「生信java」生信分析logFC可以小于1嘛

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本文目录一览：

• 1、生物信息学相关
• 2、请大家和我讲讲生物信息学和编程的关系~
• 3、生物信息分析师都需要具备哪些技能？
• 4、生物背景入门生物信息学需要补哪些计算机知识？

生物信息学相关

我也是搞bioinformatics的。

一般掌握一门简单的语言就可以了。不需要什么复杂的高级的语言。一般做bioinfo的用C/java的远远少于perl 和python。因为perl 和python太简单了。还有很多用machine learning算法做生物信息的喜欢用matlab，可以用来编程序，又有很多内建的函数和工具包。

给你看张图。以前上的一个调查

这个专业的就业。。。如果你指的“就业”是进公司的话，我可以很负责的告诉你，就业很不好，无论是在美国，欧洲还是国内。你如果是学计算机的话就业远远好过bioinformatics。 但是如果你说的就业是搞科学研究的话，那么bioinformatics比纯CS要容易很多。很容易出成果，发文章也是非常容易的。

请大家和我讲讲生物信息学和编程的关系~

个人感觉关系不是很大，生物信息学主要是通过利用计算机超高的计算能力，来解决生物中对DNA、氨基酸的处理问题，对计算机本身的技术貌似要求不是非常高。

Perl没接触过，不太清楚，但各种编程语言之间没什么很大区别，基本只要学过一种语言，再转别的使用更多的Java、C++之类的都能很快地掌握。

学习编程首先是要掌握一些基本的算法，而且具有编程的能力，这些应该是学计算机就必须要掌握的基础。

以后需要根据你要学什么再具体研究，比如以后要编软件就主要提高算法和编程能力；要对网站、或是一些较大的应用工程进行结构的构建，那主要需要在数据结构、网络应用上下些功夫。

PS：现在用Perl的多吗？怎么印象中感觉这个早都过时了？。。。

生物信息分析师都需要具备哪些技能？

1. 计算生物学、统计学、机器学习、生物信息学等相关专业

2. 国内毕业者需硕士学位或以上 （或国内本科及两年以上相关工作经验） / 海归人员需国外的本科学位或以上

3. 熟悉Linux/Unix操作系统，有HPC环境背景优先考虑

4. 熟悉生信流程创建

5. 精通PerI、R （如会Matlab、Python、C/C++中两种以上编程语言可加分）

6. 具备较强的中英文文献查询与阅读能力，并做英文书面报告

7. 精通单细胞、高通量测序数据的分析全流程者优先考虑

生物背景入门生物信息学需要补哪些计算机知识？

我在的北大的生物医学工程系里面有健康信息系统、医学数据、计算生物学方向，和传统的生信有一定的差别；真正做生信的人信息科学院有一拨，生命科学院还有一拨。不排除数学院也有理论研究专家。计算机方面的基础知识，和真正学计算机专业的同学是完全不一样的要求。不谈计算生物学里面DNA计算机一类的东西，如果是序列分析、组学这些研究的话，我现在按如下一步步来：首先，应用层面，Linux必须要会用，所有的生信软件几乎都是linux-based不会也得会，（嗯，会用，不是说要把内核源码深入解析一下什么的）主要是会文件操作，登陆服务器，权限，进程什么的各种概念，以及一些基本的生信工具BLAST等等。其次，如楼上所言，要求数据结构与算法的知识。直接被用在生信应用里面的比如BLAST的动态规划，当然其他没有直接关联的也很重要，比如之前看宏基因组分类方面的论文就有一些组用了贪心法这样的简单原理，但是也达到过很好的效果。最后，编写代码方面，需要一些技能是光上一点基础课学不来的，必须在战争中学习战争。比如说会写了python或者C，java，但是还是需要一些高级技术以及技术细节。之前在做测序数据分析的时候要求写成并行的程序，这样服务器跑起来快，免得结果等好几天。

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